Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Dyrk1a-203ENSMUST00000122284 2356 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 1700019J19Rik-205ENSMUST00000216531 2813 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Sap30bpos-201ENSMUST00000132264 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Gm11298-201ENSMUST00000120503 1799 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Tmem30c-203ENSMUST00000120112 3478 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Loxl4-201ENSMUST00000026190 3738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Diablo-207ENSMUST00000145152 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms