Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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