Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MsmbO08540 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MsmbO08540 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MsmbO08540 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MsmbO08540 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
MsmbO08540 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MsmbO08540 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
MsmbO08540 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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