Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Top6blJ3QMY9 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Top6blJ3QMY9 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Top6blJ3QMY9 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Top6blJ3QMY9 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Top6blJ3QMY9 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Top6blJ3QMY9 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Top6blJ3QMY9 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Top6blJ3QMY9 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Top6blJ3QMY9 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Top6blJ3QMY9 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Top6blJ3QMY9 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Top6blJ3QMY9 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Top6blJ3QMY9 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Top6blJ3QMY9 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Top6blJ3QMY9 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Top6blJ3QMY9 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Top6blJ3QMY9 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Top6blJ3QMY9 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Top6blJ3QMY9 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Top6blJ3QMY9 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Top6blJ3QMY9 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Top6blJ3QMY9 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Top6blJ3QMY9 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Top6blJ3QMY9 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Top6blJ3QMY9 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Top6blJ3QMY9 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Top6blJ3QMY9 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Top6blJ3QMY9 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Top6blJ3QMY9 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Top6blJ3QMY9 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Top6blJ3QMY9 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Top6blJ3QMY9 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Top6blJ3QMY9 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Top6blJ3QMY9 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Top6blJ3QMY9 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Top6blJ3QMY9 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Top6blJ3QMY9 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Top6blJ3QMY9 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Top6blJ3QMY9 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Top6blJ3QMY9 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Top6blJ3QMY9 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Top6blJ3QMY9 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Top6blJ3QMY9 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Top6blJ3QMY9 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Top6blJ3QMY9 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Top6blJ3QMY9 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Top6blJ3QMY9 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Top6blJ3QMY9 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Top6blJ3QMY9 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Top6blJ3QMY9 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Top6blJ3QMY9 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Top6blJ3QMY9 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Top6blJ3QMY9 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Top6blJ3QMY9 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Top6blJ3QMY9 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Top6blJ3QMY9 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Top6blJ3QMY9 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Top6blJ3QMY9 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Top6blJ3QMY9 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Top6blJ3QMY9 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Top6blJ3QMY9 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Top6blJ3QMY9 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Top6blJ3QMY9 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Top6blJ3QMY9 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Top6blJ3QMY9 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Top6blJ3QMY9 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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