Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Gm21818J3KMS6 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Gm21818J3KMS6 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Gm21818J3KMS6 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Gm21818J3KMS6 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Gm21818J3KMS6 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Gm21818J3KMS6 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
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