Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms