Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

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Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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