Protein–RNA interactions for Protein: G5E8J6

Hrc, Histidine rich calcium binding protein, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HrcG5E8J6 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HrcG5E8J6 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HrcG5E8J6 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HrcG5E8J6 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HrcG5E8J6 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HrcG5E8J6 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HrcG5E8J6 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HrcG5E8J6 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HrcG5E8J6 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HrcG5E8J6 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HrcG5E8J6 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HrcG5E8J6 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HrcG5E8J6 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HrcG5E8J6 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HrcG5E8J6 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HrcG5E8J6 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HrcG5E8J6 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HrcG5E8J6 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HrcG5E8J6 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HrcG5E8J6 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HrcG5E8J6 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HrcG5E8J6 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HrcG5E8J6 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HrcG5E8J6 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HrcG5E8J6 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HrcG5E8J6 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HrcG5E8J6 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HrcG5E8J6 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HrcG5E8J6 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HrcG5E8J6 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HrcG5E8J6 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HrcG5E8J6 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HrcG5E8J6 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HrcG5E8J6 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HrcG5E8J6 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HrcG5E8J6 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
HrcG5E8J6 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HrcG5E8J6 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HrcG5E8J6 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HrcG5E8J6 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HrcG5E8J6 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HrcG5E8J6 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HrcG5E8J6 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HrcG5E8J6 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HrcG5E8J6 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HrcG5E8J6 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HrcG5E8J6 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HrcG5E8J6 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HrcG5E8J6 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HrcG5E8J6 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HrcG5E8J6 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HrcG5E8J6 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HrcG5E8J6 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HrcG5E8J6 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HrcG5E8J6 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HrcG5E8J6 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HrcG5E8J6 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HrcG5E8J6 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HrcG5E8J6 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HrcG5E8J6 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HrcG5E8J6 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HrcG5E8J6 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HrcG5E8J6 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HrcG5E8J6 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HrcG5E8J6 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HrcG5E8J6 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HrcG5E8J6 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HrcG5E8J6 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HrcG5E8J6 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HrcG5E8J6 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HrcG5E8J6 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HrcG5E8J6 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HrcG5E8J6 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HrcG5E8J6 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HrcG5E8J6 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HrcG5E8J6 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HrcG5E8J6 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HrcG5E8J6 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HrcG5E8J6 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HrcG5E8J6 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HrcG5E8J6 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HrcG5E8J6 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HrcG5E8J6 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HrcG5E8J6 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HrcG5E8J6 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HrcG5E8J6 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HrcG5E8J6 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HrcG5E8J6 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HrcG5E8J6 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HrcG5E8J6 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HrcG5E8J6 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HrcG5E8J6 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HrcG5E8J6 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HrcG5E8J6 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HrcG5E8J6 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HrcG5E8J6 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HrcG5E8J6 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HrcG5E8J6 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HrcG5E8J6 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HrcG5E8J6 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.9 ms