Protein–RNA interactions for Protein: G5E8I7

Usp17lc, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein C, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lcG5E8I7 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
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Usp17lcG5E8I7 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Usp17lcG5E8I7 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp17lcG5E8I7 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
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