Protein–RNA interactions for Protein: F8VPX6

Speer4a, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4aF8VPX6 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Speer4aF8VPX6 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Speer4aF8VPX6 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Speer4aF8VPX6 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Speer4aF8VPX6 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Speer4aF8VPX6 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Speer4aF8VPX6 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Speer4aF8VPX6 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Speer4aF8VPX6 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Speer4aF8VPX6 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Speer4aF8VPX6 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Speer4aF8VPX6 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Speer4aF8VPX6 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Speer4aF8VPX6 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Speer4aF8VPX6 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Speer4aF8VPX6 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Speer4aF8VPX6 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Speer4aF8VPX6 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Speer4aF8VPX6 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Speer4aF8VPX6 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Speer4aF8VPX6 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Speer4aF8VPX6 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer4aF8VPX6 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer4aF8VPX6 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer4aF8VPX6 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer4aF8VPX6 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer4aF8VPX6 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer4aF8VPX6 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer4aF8VPX6 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer4aF8VPX6 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer4aF8VPX6 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer4aF8VPX6 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer4aF8VPX6 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer4aF8VPX6 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer4aF8VPX6 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer4aF8VPX6 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer4aF8VPX6 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer4aF8VPX6 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer4aF8VPX6 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer4aF8VPX6 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer4aF8VPX6 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer4aF8VPX6 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer4aF8VPX6 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer4aF8VPX6 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer4aF8VPX6 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer4aF8VPX6 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer4aF8VPX6 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer4aF8VPX6 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer4aF8VPX6 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer4aF8VPX6 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer4aF8VPX6 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer4aF8VPX6 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer4aF8VPX6 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Speer4aF8VPX6 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Speer4aF8VPX6 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Speer4aF8VPX6 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Speer4aF8VPX6 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Speer4aF8VPX6 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Speer4aF8VPX6 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Speer4aF8VPX6 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms