Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms