Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q2

R3hdm1, R3H domain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,135 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3hdm1E9Q9Q2 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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R3hdm1E9Q9Q2 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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R3hdm1E9Q9Q2 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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