Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms