Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.6 ms