Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syce3B5KM66 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syce3B5KM66 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syce3B5KM66 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syce3B5KM66 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syce3B5KM66 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syce3B5KM66 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Syce3B5KM66 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syce3B5KM66 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Syce3B5KM66 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syce3B5KM66 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syce3B5KM66 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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