Protein–RNA interactions for Protein: B2RQC2

Usp42, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp42B2RQC2 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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