Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Trabd2bB1ATG9 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Trabd2bB1ATG9 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Trabd2bB1ATG9 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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