Protein–RNA interactions for Protein: A3KG49

Gm5640, Predicted gene 5640, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5640A3KG49 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5640A3KG49 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms