Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms