Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms