Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms