Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
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Pdpk1Q9Z2A0 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Pdpk1Q9Z2A0 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Pdpk1Q9Z2A0 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Pdpk1Q9Z2A0 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Pdpk1Q9Z2A0 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Pdpk1Q9Z2A0 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Pdpk1Q9Z2A0 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Pdpk1Q9Z2A0 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Pdpk1Q9Z2A0 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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