Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 4930412E21Rik-201ENSMUST00000194267 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms