Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms