Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
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Tgm1Q9JLF6 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Tgm1Q9JLF6 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Tgm1Q9JLF6 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Tgm1Q9JLF6 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Tgm1Q9JLF6 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Tgm1Q9JLF6 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Tgm1Q9JLF6 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Tgm1Q9JLF6 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Tgm1Q9JLF6 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Tgm1Q9JLF6 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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