Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trem1Q9JKE2 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trem1Q9JKE2 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trem1Q9JKE2 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Trem1Q9JKE2 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trem1Q9JKE2 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trem1Q9JKE2 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms