Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL5

Tulp4, Tubby-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp4Q9JIL5 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tulp4Q9JIL5 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tulp4Q9JIL5 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tulp4Q9JIL5 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tulp4Q9JIL5 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tulp4Q9JIL5 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tulp4Q9JIL5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tulp4Q9JIL5 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tulp4Q9JIL5 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tulp4Q9JIL5 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tulp4Q9JIL5 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tulp4Q9JIL5 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tulp4Q9JIL5 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tulp4Q9JIL5 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tulp4Q9JIL5 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tulp4Q9JIL5 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tulp4Q9JIL5 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tulp4Q9JIL5 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tulp4Q9JIL5 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tulp4Q9JIL5 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tulp4Q9JIL5 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tulp4Q9JIL5 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tulp4Q9JIL5 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tulp4Q9JIL5 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tulp4Q9JIL5 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tulp4Q9JIL5 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tulp4Q9JIL5 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tulp4Q9JIL5 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tulp4Q9JIL5 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tulp4Q9JIL5 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tulp4Q9JIL5 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tulp4Q9JIL5 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tulp4Q9JIL5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tulp4Q9JIL5 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tulp4Q9JIL5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tulp4Q9JIL5 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tulp4Q9JIL5 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tulp4Q9JIL5 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tulp4Q9JIL5 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tulp4Q9JIL5 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tulp4Q9JIL5 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tulp4Q9JIL5 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tulp4Q9JIL5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tulp4Q9JIL5 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tulp4Q9JIL5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tulp4Q9JIL5 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tulp4Q9JIL5 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tulp4Q9JIL5 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tulp4Q9JIL5 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tulp4Q9JIL5 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tulp4Q9JIL5 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tulp4Q9JIL5 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tulp4Q9JIL5 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tulp4Q9JIL5 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tulp4Q9JIL5 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tulp4Q9JIL5 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tulp4Q9JIL5 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tulp4Q9JIL5 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tulp4Q9JIL5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tulp4Q9JIL5 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tulp4Q9JIL5 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tulp4Q9JIL5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tulp4Q9JIL5 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tulp4Q9JIL5 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tulp4Q9JIL5 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tulp4Q9JIL5 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tulp4Q9JIL5 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tulp4Q9JIL5 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tulp4Q9JIL5 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tulp4Q9JIL5 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tulp4Q9JIL5 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Tulp4Q9JIL5 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Tulp4Q9JIL5 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Tulp4Q9JIL5 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Tulp4Q9JIL5 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tulp4Q9JIL5 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tulp4Q9JIL5 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tulp4Q9JIL5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tulp4Q9JIL5 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tulp4Q9JIL5 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tulp4Q9JIL5 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tulp4Q9JIL5 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tulp4Q9JIL5 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tulp4Q9JIL5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tulp4Q9JIL5 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tulp4Q9JIL5 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tulp4Q9JIL5 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tulp4Q9JIL5 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tulp4Q9JIL5 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tulp4Q9JIL5 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tulp4Q9JIL5 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tulp4Q9JIL5 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tulp4Q9JIL5 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tulp4Q9JIL5 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tulp4Q9JIL5 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tulp4Q9JIL5 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tulp4Q9JIL5 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tulp4Q9JIL5 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tulp4Q9JIL5 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tulp4Q9JIL5 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms