Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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