Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube3bQ9ES34 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube3bQ9ES34 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube3bQ9ES34 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube3bQ9ES34 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube3bQ9ES34 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube3bQ9ES34 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube3bQ9ES34 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube3bQ9ES34 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube3bQ9ES34 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube3bQ9ES34 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube3bQ9ES34 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube3bQ9ES34 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube3bQ9ES34 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube3bQ9ES34 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube3bQ9ES34 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube3bQ9ES34 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube3bQ9ES34 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube3bQ9ES34 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube3bQ9ES34 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ube3bQ9ES34 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ube3bQ9ES34 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ube3bQ9ES34 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ube3bQ9ES34 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ube3bQ9ES34 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ube3bQ9ES34 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ube3bQ9ES34 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ube3bQ9ES34 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ube3bQ9ES34 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ube3bQ9ES34 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ube3bQ9ES34 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ube3bQ9ES34 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ube3bQ9ES34 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ube3bQ9ES34 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ube3bQ9ES34 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ube3bQ9ES34 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube3bQ9ES34 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube3bQ9ES34 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube3bQ9ES34 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube3bQ9ES34 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube3bQ9ES34 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube3bQ9ES34 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube3bQ9ES34 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube3bQ9ES34 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube3bQ9ES34 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube3bQ9ES34 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube3bQ9ES34 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube3bQ9ES34 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube3bQ9ES34 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube3bQ9ES34 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube3bQ9ES34 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube3bQ9ES34 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube3bQ9ES34 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube3bQ9ES34 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube3bQ9ES34 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube3bQ9ES34 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube3bQ9ES34 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube3bQ9ES34 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube3bQ9ES34 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube3bQ9ES34 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube3bQ9ES34 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube3bQ9ES34 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube3bQ9ES34 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube3bQ9ES34 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube3bQ9ES34 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube3bQ9ES34 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube3bQ9ES34 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube3bQ9ES34 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube3bQ9ES34 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube3bQ9ES34 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube3bQ9ES34 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube3bQ9ES34 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube3bQ9ES34 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube3bQ9ES34 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube3bQ9ES34 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube3bQ9ES34 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube3bQ9ES34 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube3bQ9ES34 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube3bQ9ES34 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube3bQ9ES34 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube3bQ9ES34 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube3bQ9ES34 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube3bQ9ES34 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube3bQ9ES34 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube3bQ9ES34 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube3bQ9ES34 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube3bQ9ES34 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube3bQ9ES34 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube3bQ9ES34 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube3bQ9ES34 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube3bQ9ES34 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube3bQ9ES34 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube3bQ9ES34 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube3bQ9ES34 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube3bQ9ES34 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube3bQ9ES34 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube3bQ9ES34 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube3bQ9ES34 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube3bQ9ES34 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube3bQ9ES34 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms