Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Wdr61Q9ERF3 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms