Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms