Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER63

Tnfrsf23, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 23, mousemouse

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Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf23Q9ER63 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms