Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms