Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Vmn1r47-201ENSMUST00000074881 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Araf-202ENSMUST00000120356 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Gm28440-201ENSMUST00000186328 1499 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Pfn4-201ENSMUST00000020967 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Gm24374-201ENSMUST00000104394 106 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Gm23987-201ENSMUST00000117039 129 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Gm14358-201ENSMUST00000118458 403 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Gm42504-201ENSMUST00000198312 525 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 8030487O14Rik-201ENSMUST00000200244 903 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Sycp3-201ENSMUST00000020252 1139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 AL929285.1-201ENSMUST00000215522 229 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 AC138027.1-201ENSMUST00000218324 472 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 AC118230.1-201ENSMUST00000220196 656 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 AC108437.1-201ENSMUST00000222170 776 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Cd226-202ENSMUST00000097496 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Gm10801-201ENSMUST00000099684 504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Olfr259-201ENSMUST00000099862 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Ralyl-201ENSMUST00000108372 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Gm9877-201ENSMUST00000064271 2627 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Mup3-202ENSMUST00000107472 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Gm14606-201ENSMUST00000117078 1155 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Vmn1r-ps126-201ENSMUST00000117681 926 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Gm14610-201ENSMUST00000118358 966 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Gm9027-201ENSMUST00000165914 661 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 2610001J05Rik-204ENSMUST00000185361 767 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Gm5309-201ENSMUST00000197416 677 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 AC121788.2-201ENSMUST00000218284 1255 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Gm18024-201ENSMUST00000218516 690 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 AC168880.1-201ENSMUST00000225113 707 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Rfpl4-201ENSMUST00000045215 1598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms