Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms