Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

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Length 389 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rsph3bQ9DA80 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rsph3bQ9DA80 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rsph3bQ9DA80 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rsph3bQ9DA80 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rsph3bQ9DA80 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rsph3bQ9DA80 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rsph3bQ9DA80 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rsph3bQ9DA80 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rsph3bQ9DA80 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rsph3bQ9DA80 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rsph3bQ9DA80 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rsph3bQ9DA80 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rsph3bQ9DA80 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rsph3bQ9DA80 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rsph3bQ9DA80 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rsph3bQ9DA80 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rsph3bQ9DA80 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rsph3bQ9DA80 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rsph3bQ9DA80 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rsph3bQ9DA80 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rsph3bQ9DA80 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rsph3bQ9DA80 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rsph3bQ9DA80 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rsph3bQ9DA80 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rsph3bQ9DA80 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rsph3bQ9DA80 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rsph3bQ9DA80 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rsph3bQ9DA80 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rsph3bQ9DA80 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rsph3bQ9DA80 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rsph3bQ9DA80 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rsph3bQ9DA80 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Rsph3bQ9DA80 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Rsph3bQ9DA80 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rsph3bQ9DA80 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Rsph3bQ9DA80 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Rsph3bQ9DA80 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rsph3bQ9DA80 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rsph3bQ9DA80 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rsph3bQ9DA80 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rsph3bQ9DA80 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rsph3bQ9DA80 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rsph3bQ9DA80 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rsph3bQ9DA80 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Rsph3bQ9DA80 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rsph3bQ9DA80 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rsph3bQ9DA80 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rsph3bQ9DA80 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rsph3bQ9DA80 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rsph3bQ9DA80 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rsph3bQ9DA80 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rsph3bQ9DA80 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rsph3bQ9DA80 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rsph3bQ9DA80 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rsph3bQ9DA80 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rsph3bQ9DA80 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rsph3bQ9DA80 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rsph3bQ9DA80 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rsph3bQ9DA80 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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