Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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