Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms