Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
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Cldn23Q9D7D7 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Cldn23Q9D7D7 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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