Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q1

Ribc2, RIB43A-like with coiled-coils protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc2Q9D4Q1 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms