Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms