Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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