Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

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Length 818 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Snx29Q9D3S3 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Snx29Q9D3S3 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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