Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fndc8Q9D2H8 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms