Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms