Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms