Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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