Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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