Protein–RNA interactions for Protein: Q99N95

Mrpl3, 39S ribosomal protein L3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl3Q99N95 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms