Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.7 ms